GNPS ProteoSAFe工作流程 该公共存储库包含在GNPS 上运行的GNPS工作流。 为GNPS做贡献 GNPS社区始终欢迎您的建议和贡献。 成为社区的一份子,贡献自己的力量! GitHub储存库 诚挚地邀请您在我们的GitHub存储库上打开“问题”,并提出对我们的文档和工作流程的更改。 我们也欢迎对相应存储库的直接拉取请求。 指向文档网站GNPS_Documentation GitHub存储库。 GNPS_Workflows当前的GitHub存储库,其中包含GNPS 上可用的工作流: GNPS论坛 也可以在GNPS论坛上通过讨论和提出建议。 GNPS核心Web服务器状态 GNPS集成Web和工作流作业在。 特征 服务器状态 GNPS / Beta / MassIVE API测试 GNPS外部API测试 GNPS / Beta / MassIVESelenium测试 G
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埃尔·Maven 直观的开源LC-MS数据处理工具 从 指数 产品特点 和具有以下功能: 多文件色谱比对仪 峰值特征检测器 同位素计算器 El-MAVEN与Maven相比,功能强大,速度更快且具有更多用户友好功能,并且包括以下附加功能: 加合物计算器 碎片光谱匹配 峰编辑器 下载 El-MAVEN安装程序可用于Windows(7及更高版本)和Mac OS(10.12及更高版本)。 用户可以从下载这些平台的最新版本。 从源代码构建 贡献者和开发人员可以按照以下说明在Windows,Ubuntu或Mac OS上构建El-MAVEN。 建立开发环境 设置开发环境(仅64位平台) 三种操作系统
2022-02-11 23:15:11 266.36MB c-plus-plus qt metabolomics mass-spectrometry
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我们的项目 简称W4M的是法国的基础架构,提供软件工具处理,分析和注释代谢组学数据的功能。 它基于Galaxy平台。 在代谢组学()和生物信息学平台( )之间的协作中,我们已经使用Galaxy框架开发了完整的LC / MS,GC / MS和NMR管道,用于数据分析,包括预处理,标准化,质量控制,统计分析和注释步骤。 这些模块化和可扩展的工作流程由现有的组件(XCMS和CAMERA软件包等)组成,还包括一整套互补的自制工具。 可通过Web界面访问此实现,以确保参数的完整性。 Galaxy的高级功能使来自不同来源和不同类型的组件的集成成为可能。 因此,为代谢组学界(平台,最终用户等)提供了可扩展的虚拟研究环境(VRE),使新用户以及本领域专家可以共享预配置的工作流程。 引文 Giacomoni F.,LeCorguilléG.,Monsoor M.,Landi M.,Pericard P.,
2021-11-17 16:03:40 12.34MB nmr metabolomics lc-ms galaxy-project
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爱马仕 RHermes是一种广泛的靶向代谢组学软件,用于分析LC-MS和LC-MS / MS数据,以鉴定生物或环境样品中的化合物。 RHermes工作流程可与Orbitrap和q-TOF仪器数据一起使用,并带有易于使用的GUI,它将指导您完成每一步。 在查看文档 系统要求 推荐的系统要求是: 至少4核处理器 8-16 GB RAM或更多 Internet连接以执行KEGG查询 安装 您可以使用以下方法从下载开发版本: if ( ! requireNamespace( " devtools " , quietly = TRUE )) install.packages( " devtools " ) devtools :: install_github( " RogerGinBer/RHermes " ) 设置 RHermes在安装后几乎可以执行其所有功能,但是SOI Blank
2021-03-19 09:12:28 3.57MB gui r metabolomics metabolite-identification
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xcms:这是与Bioconductor软件包匹配的git存储库xcms:LCMS和GCMS数据分析
2021-02-05 15:10:21 894KB r feature-detection bioconductor metabolomics
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