Louvain聚类和蛋白质间相互作用(PPI)网络的集中度分析 该存储库包含python脚本 从PPI网络中检测具有统计意义的重要社区。 进行集中度分析 要求 python 3.0 网络x 2.4 qstest 1.1.0 熊猫1.0.4 用法 用于重大社区发现 python python/find__significant_module.py -n example/example_network.txt -g example/example_input.txt -o output_dir 有关详细信息: python python/find__significant_module.py -h 用于中心性分析 python python/perform_centrality_analysis.py -n example/example_network.txt -g exampl
2021-12-30 14:44:05 57KB community ppi network-module louvain-algorithm
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python离线安装包,亲测可用
2021-12-21 21:02:54 92KB python
python离线安装包,亲测可用
2021-12-21 21:02:48 92KB python
python离线安装包,亲测可用
2021-12-21 21:02:43 92KB python
鲁汶社区检测 正在安装 要从源代码构建和安装,请运行 python setup.py install 您也可以从pip安装 pip install python-louvain pip上的软件包名称是python-louvain但已作为community导入到python中。 有关此模块的更多文档,请参见 用法 用作Python库 import community as community_louvain import matplotlib . cm as cm import matplotlib . pyplot as plt import networkx as nx # load the karate club graph G = nx . karate_club_graph () # compute the best partition partition = communit
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matlab分时代码GenLouvain版本2.2 2019年7月发行 请引用此代码,例如Lucas GS Jeub,Marya Bazzi,Inderjit S. Jutla和Peter J. Mucha, “在MATLAB中实现的用于社区检测的通用Louvain方法,” (2011-2019年)。 内容: 该软件包包含主要的genlouvain.m文件,该文件调用许多实现为mex函数的子例程。 mex文件的源代码包含在“ MEX_SRC”目录中。 专用目录中包含针对64位Mac,Windows和Linux系统的预编译可执行文件。 它还包括genlouvain ,它通过可选的后处理将genlouvain iterated_genlouvain.m地应用于上genlouvain运行的输出分区。 “ HelperFunctions”目录中包含用于计算模块化矩阵和后处理分区的函数。 后处理功能使用Markus Buehren的代码(包含在“ Assignment”目录中,可在处找到)来解决最佳分配问题。 安装说明: 确保“ GenLouvain”文件夹及其所有子文件夹在MATLAB路径中,
2021-11-21 21:09:04 555KB 系统开源
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改进的Louvain社团划分算法
2021-09-02 14:36:50 728KB 研究论文
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Louvain-算法 Louvain算法的实现 该算法的详细信息可以在论文中找到:“大型网络中社区的快速展开,Vincent D Blondel、Jean-Loup Guillaume、Renaud Lambiotte、Etienne Lefebvre,Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment 2008 (10), P10008 ( 12pp) doi: 10.1088/1742-5468/2008/10/P10008.ArXiv: " 要使用此程序,输入数据格式应与 SNAP 的数据集相同。
2021-08-25 10:57:26 5KB C++
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dga-graphx GraphX算法 dga-graphX软件包包含使用GraphX框架在Spark上构建的几种预构建的可执行图算法。 前提条件 [Spark]( )0.9.0或更高版本 [graphX]( ) [Gradle]( ) 建造 如有必要,请编辑build.gradle文件以设置您的spark和graphX版本 gradle clean dist 检查build / dist文件夹中的dga-graphx-0.1.jar。 演算法 鲁汶 关于卢万 Louvain分布式社区检测是这项工作的并行版本: Fast unfolding of communities in large networks, Vincent D Blondel, Jean-Loup Guillaume, Renaud Lambiotte, Etienne Lefebvre, Journal
2021-08-24 13:59:44 27KB 附件源码 文章源码
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