funannotate:真核基因组注释管道

上传者: 42127020 | 上传时间: 2022-11-10 17:27:28 | 文件大小: 537KB | 文件类型: ZIP
funannotate是用于基因组注释的管道(专门为真菌构建,但也可用于高级真核生物)。 有关安装,使用和更多信息,请参见 最快启动Docker: 您可以使用funannotate运行funannotate 。 需要注意的是,GeneMark不包含在Docker映像中(请参阅下面的许可,您可以向开发人员投诉,因为它难以分发/使用)。 我还编写了一个bash脚本,该脚本可以运行docker映像并自动检测/包括正确的用户/卷绑定。 该docker映像是基于master中的最新代码构建的,因此它将早于标记的发行版。 该映像还包括所需的数据库,如果您只想在没有数据库的情况下进行注解,则该映像位于nextgenusfs/funannotate-slim hub以及nextgenusfs/funannotate-slim 。 因此,可以通过以下方式实现此路线: # download/pull th

文件下载

资源详情

[{"title":"( 109 个子文件 537KB ) funannotate:真核基因组注释管道","children":[{"title":"MANIFEST.in <span style='color:#111;'> 315B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"compare.rst <span style='color:#111;'> 2.09KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"conf.py <span style='color:#111;'> 5.07KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"docker.rst <span style='color:#111;'> 3.25KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"commands.rst <span style='color:#111;'> 40.63KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"......","children":null,"spread":false},{"title":"<span style='color:steelblue;'>文件过多,未全部展示</span>","children":null,"spread":false}],"spread":true}]

评论信息

免责申明

【只为小站】的资源来自网友分享,仅供学习研究,请务必在下载后24小时内给予删除,不得用于其他任何用途,否则后果自负。基于互联网的特殊性,【只为小站】 无法对用户传输的作品、信息、内容的权属或合法性、合规性、真实性、科学性、完整权、有效性等进行实质审查;无论 【只为小站】 经营者是否已进行审查,用户均应自行承担因其传输的作品、信息、内容而可能或已经产生的侵权或权属纠纷等法律责任。
本站所有资源不代表本站的观点或立场,基于网友分享,根据中国法律《信息网络传播权保护条例》第二十二条之规定,若资源存在侵权或相关问题请联系本站客服人员,zhiweidada#qq.com,请把#换成@,本站将给予最大的支持与配合,做到及时反馈和处理。关于更多版权及免责申明参见 版权及免责申明